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Eine Analfistel ist meist Folge eines ehemals vorhandenen Analabszesses, also einer entzündlichen, abgekapselten Eiterhöhlung. Im Gegensatz zum Abszess, handelt es sich bei einer Fistel um eine langsam schleichende Entzündung, die sich in Richtung des geringsten Widerstandes im Gewebe ausbreitet. Es entstehen dabei dünne, kanalartige Gänge, die häufig aber nicht zwangsläufig Ausführungsöffnungen zur Hautoberfläche des Afterbereichs zeigen. Allerdings können sich die Ausführungsgänge zuch zur Schleimhautseite hin entwickeln. Existiert eine Öffnung zur Hautoberfläche, tritt die für Fisteln typische Sekretion aus.